Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Nek10-206ENSMUST00000224491 9567 ntAPPRIS P2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Mtif2-201ENSMUST00000020749 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NipblQ6KCD5 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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NipblQ6KCD5 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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NipblQ6KCD5 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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NipblQ6KCD5 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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NipblQ6KCD5 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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NipblQ6KCD5 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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NipblQ6KCD5 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Cep57l1-205ENSMUST00000187143 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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