Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ccdc18Q640L5 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ccdc18Q640L5 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ccdc18Q640L5 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Scn11a-202ENSMUST00000215718 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Cdk6-202ENSMUST00000165117 11525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc18Q640L5 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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