Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Mmp9P41245 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Mmp9P41245 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Mmp9P41245 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Mmp9P41245 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Mmp9P41245 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Mmp9P41245 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Mmp9P41245 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Mmp9P41245 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Mmp9P41245 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Mmp9P41245 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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Mmp9P41245 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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Mmp9P41245 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Mmp9P41245 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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