Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RxraP28700 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC6.52□□□□□ -1.36
RxraP28700 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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