Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd10P28359 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms