Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Slc17a6-201ENSMUST00000032710 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Smyd3-204ENSMUST00000128302 6871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms