Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxb2P0C1T1 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms