Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rrn3B2RS91 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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