Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rabgef1Q9JM13 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm4800-201ENSMUST00000215776 1266 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rabgef1Q9JM13 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms