Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Hypk-202ENSMUST00000110612 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Nvl-201ENSMUST00000027797 9392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Ap5m1-201ENSMUST00000037473 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Zkscan8-201ENSMUST00000045228 8805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm44178-201ENSMUST00000205229 2930 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Szt2-201ENSMUST00000075406 10965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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