Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp27Q8CEG8 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms