Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Ccdc88cQ6VGS5 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms