Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Rnf214-209ENSMUST00000161203 3294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d24-204ENSMUST00000167791 4383 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Rfx3-208ENSMUST00000174850 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm26629-201ENSMUST00000180848 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 4930533D04Rik-201ENSMUST00000185478 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm19409-201ENSMUST00000198244 2858 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Anxa10-201ENSMUST00000034052 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Neurod1-201ENSMUST00000041099 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Dgcr2-202ENSMUST00000066127 3790 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Prpf31-201ENSMUST00000008517 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Map3k19-205ENSMUST00000208183 4865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Usp7-208ENSMUST00000161046 4003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 AC160340.1-201ENSMUST00000222952 3964 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Sptbn1-203ENSMUST00000102838 9107 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 L1td1-202ENSMUST00000154279 2942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Trp63-203ENSMUST00000115304 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Pcsk2-201ENSMUST00000028905 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm43420-201ENSMUST00000198012 1857 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Lrrc43Q3V0L5 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Nqo1-201ENSMUST00000003947 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Lrrc43Q3V0L5 Slc1a7-201ENSMUST00000106713 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Klf12-205ENSMUST00000228216 5890 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Adgrl3-216ENSMUST00000121641 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 D130017N08Rik-202ENSMUST00000180951 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Lrrc43Q3V0L5 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Lrrc43Q3V0L5 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Lrrc43Q3V0L5 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Lrrc43Q3V0L5 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Osbpl9-218ENSMUST00000162787 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Lrrc43Q3V0L5 9430073C21Rik-201ENSMUST00000145346 2173 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Rufy3-207ENSMUST00000199312 2182 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm44812-201ENSMUST00000207627 5349 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm35048-201ENSMUST00000192105 2802 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Zfp248-201ENSMUST00000069292 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Zfp445-206ENSMUST00000216063 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Zfp40-201ENSMUST00000037057 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Lin7a-202ENSMUST00000105280 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrrc43Q3V0L5 Mterf4-203ENSMUST00000112944 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Lrrc43Q3V0L5 Clcn3-205ENSMUST00000110302 3768 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms