Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Zfp661-204ENSMUST00000164551 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm20511-201ENSMUST00000174079 456 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Ms4a3-202ENSMUST00000186023 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Slamf6-204ENSMUST00000194561 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm43797-201ENSMUST00000198221 532 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm14267-208ENSMUST00000228324 1189 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Stag1-201ENSMUST00000041418 5909 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm44037-201ENSMUST00000204816 1891 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm7444-201ENSMUST00000217455 2428 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Hnrnpc-209ENSMUST00000228198 2498 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm6878-201ENSMUST00000100448 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Ncaph2-202ENSMUST00000074552 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Utp15-201ENSMUST00000040972 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Lrrc49-202ENSMUST00000065603 3017 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Tbc1d24-204ENSMUST00000167791 4383 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Tbc1d24-214ENSMUST00000201960 4305 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gfral-201ENSMUST00000074880 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm13573-201ENSMUST00000116410 631 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm13458-201ENSMUST00000118239 367 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm12987-201ENSMUST00000118562 489 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 A630023P12Rik-201ENSMUST00000129007 1221 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm44764-202ENSMUST00000204912 671 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm8838-201ENSMUST00000212978 541 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm6869-201ENSMUST00000220334 734 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Klrb1b-201ENSMUST00000032472 2228 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm37446-201ENSMUST00000193015 4136 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Epn2-212ENSMUST00000178202 4317 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Adcy4-202ENSMUST00000170223 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Mageb2-202ENSMUST00000201779 1551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Zfp39-201ENSMUST00000102703 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Blzf1-201ENSMUST00000027866 3948 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Pcdhga7-202ENSMUST00000193476 3044 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Rc3h2-203ENSMUST00000112936 5828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Rnf214-209ENSMUST00000161203 3294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sox12Q04890 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms