Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms