Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Map1a-201ENSMUST00000094639 11825 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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