Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Gm21818J3KMS6 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Gm21818J3KMS6 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms