Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Cd200r4-201ENSMUST00000114626 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Akap2-204ENSMUST00000102902 6993 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Usp9yF8VPU6 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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