Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Etl4-206ENSMUST00000114608 6635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Trim2-206ENSMUST00000107695 7200 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Ctnnd1-208ENSMUST00000111677 5789 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprbB2RU80 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms