Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Klhl32-203ENSMUST00000108214 5970 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Plec-221ENSMUST00000171562 14944 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Plec-204ENSMUST00000072692 14944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Uggt1-201ENSMUST00000046875 9033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Zmym5-202ENSMUST00000111285 5351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Chd8-212ENSMUST00000200169 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Zbtb18-201ENSMUST00000077225 4944 ntAPPRIS P3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Col5a3Q9JLI2 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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