Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Smg9Q9DB90 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
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Smg9Q9DB90 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Smg9Q9DB90 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Smg9Q9DB90 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Smg9Q9DB90 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Smg9Q9DB90 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Smg9Q9DB90 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Smg9Q9DB90 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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Smg9Q9DB90 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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Smg9Q9DB90 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Smg9Q9DB90 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Smg9Q9DB90 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Smg9Q9DB90 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Smg9Q9DB90 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Smg9Q9DB90 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Smg9Q9DB90 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Smg9Q9DB90 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Smg9Q9DB90 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Smg9Q9DB90 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Smg9Q9DB90 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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