Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms