Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Prpf39Q8K2Z2 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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