Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Dsg1bQ7TSF1 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms