Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Klhdc9Q3USL1 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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