Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trafd1Q3UDK1 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Trafd1Q3UDK1 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.9 ms