Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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Rpusd2Q149F1 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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Rpusd2Q149F1 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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Rpusd2Q149F1 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Rpusd2Q149F1 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Rpusd2Q149F1 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Rpusd2Q149F1 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Rpusd2Q149F1 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Ccdc127-203ENSMUST00000160021 2682 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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Rpusd2Q149F1 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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