Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Ebf1Q07802 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Ebf1Q07802 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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Ebf1Q07802 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Ebf1Q07802 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Ebf1Q07802 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Ebf1Q07802 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ebf1Q07802 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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