Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PrkcqQ02111 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PrkcqQ02111 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PrkcqQ02111 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PrkcqQ02111 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PrkcqQ02111 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PrkcqQ02111 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PrkcqQ02111 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PrkcqQ02111 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PrkcqQ02111 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PrkcqQ02111 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms