Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Usp4P35123 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Usp4P35123 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Usp4P35123 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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Usp4P35123 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Usp4P35123 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Usp4P35123 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Usp4P35123 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Usp4P35123 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp4P35123 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Usp4P35123 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Usp4P35123 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Usp4P35123 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp4P35123 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp4P35123 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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