Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm30692-201ENSMUST00000208709 801 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 CT033781.3-201ENSMUST00000221886 504 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rom1P32958 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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