Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Polq-201ENSMUST00000054034 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 1110002E22Rik-201ENSMUST00000163080 9741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Vmn1r51-204ENSMUST00000226977 4357 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Rorb-203ENSMUST00000112832 9293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Dclre1b-204ENSMUST00000106834 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Fam60a-209ENSMUST00000203164 2442 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Mum1l1-203ENSMUST00000113043 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms