Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC132304.1-201ENSMUST00000218860 135 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr1388-201ENSMUST00000055584 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 A630095E13Rik-201ENSMUST00000093868 619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28485-201ENSMUST00000185300 1500 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28684-201ENSMUST00000185586 1500 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28422-201ENSMUST00000186112 1500 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29447-201ENSMUST00000186407 1500 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29628-201ENSMUST00000187206 1500 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28316-201ENSMUST00000187576 1500 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29313-201ENSMUST00000187866 1500 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28252-201ENSMUST00000188457 1500 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28950-203ENSMUST00000188826 1500 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29303-201ENSMUST00000189215 1500 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28220-201ENSMUST00000189607 1500 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29342-202ENSMUST00000189689 1500 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29116-202ENSMUST00000189963 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29081-203ENSMUST00000190140 1500 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm28726-201ENSMUST00000190994 1500 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm29386-203ENSMUST00000191185 1500 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm33954-202ENSMUST00000195188 1500 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 0610037L13Rik-204ENSMUST00000106727 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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PdgfaP20033 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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PdgfaP20033 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Mlip-212ENSMUST00000184848 1019 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PdgfaP20033 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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