Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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Ptpn9O35239 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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Ptpn9O35239 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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Ptpn9O35239 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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Ptpn9O35239 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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Ptpn9O35239 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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Ptpn9O35239 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Ptpn9O35239 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Ptpn9O35239 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Ptpn9O35239 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Ptpn9O35239 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ptpn9O35239 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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