Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Rnf4Q9QZS2 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Rnf4Q9QZS2 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Rnf4Q9QZS2 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Rnf4Q9QZS2 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rnf4Q9QZS2 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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