Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Zfp831-201ENSMUST00000059452 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Zfp292-202ENSMUST00000098163 9941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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Col5a3Q9JLI2 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Col5a3Q9JLI2 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Col5a3Q9JLI2 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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Col5a3Q9JLI2 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Med13l-202ENSMUST00000201010 7781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Zfp507-201ENSMUST00000061586 6693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Cntn2-201ENSMUST00000086521 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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