Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Rnft1Q9DCN7 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Rnft1Q9DCN7 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Rnft1Q9DCN7 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Rnft1Q9DCN7 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Rnft1Q9DCN7 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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