Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm28645-201ENSMUST00000185859 564 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm18970-201ENSMUST00000186040 938 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Nop56Q9D6Z1 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Nop56Q9D6Z1 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Nop56Q9D6Z1 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Nop56Q9D6Z1 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Nop56Q9D6Z1 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Nop56Q9D6Z1 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Nop56Q9D6Z1 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Nop56Q9D6Z1 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Nop56Q9D6Z1 4933400F21Rik-201ENSMUST00000186098 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Nop56Q9D6Z1 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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Nop56Q9D6Z1 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 4930557K07Rik-201ENSMUST00000205110 363 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm45672-201ENSMUST00000209700 768 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 AC163660.3-202ENSMUST00000224917 464 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Asb12-201ENSMUST00000033549 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Nop56Q9D6Z1 Pglyrp4-201ENSMUST00000047745 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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