Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Trim12aQ99PQ1 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms