Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg4dQ8BGV9 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg4dQ8BGV9 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.5 ms