Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Bambi-ps1-201ENSMUST00000121525 592 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 4930535O05Rik-201ENSMUST00000184406 419 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 AC163041.2-201ENSMUST00000223082 573 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ubash3bQ8BGG7 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms