Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Helz2-203ENSMUST00000121484 10063 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Myt1-203ENSMUST00000108757 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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NischQ80TM9 Sptbn1-203ENSMUST00000102838 9107 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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NischQ80TM9 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Ppp2r3c-201ENSMUST00000021410 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 C78859-201ENSMUST00000212800 5943 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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NischQ80TM9 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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NischQ80TM9 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 4932431P20Rik-202ENSMUST00000141713 9288 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NischQ80TM9 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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