Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Vmn1r51-204ENSMUST00000226977 4357 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Mrpl19-201ENSMUST00000032124 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 AC156802.2-201ENSMUST00000225239 5740 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Mum1l1-203ENSMUST00000113043 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 4931406P16Rik-201ENSMUST00000085592 5798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Zbtb18-201ENSMUST00000077225 4944 ntAPPRIS P3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Shank3Q4ACU6 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
Shank3Q4ACU6 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Shank3Q4ACU6 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Shank3Q4ACU6 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Shank3Q4ACU6 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Shank3Q4ACU6 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Shank3Q4ACU6 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Shank3Q4ACU6 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Shank3Q4ACU6 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Shank3Q4ACU6 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Shank3Q4ACU6 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Shank3Q4ACU6 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Shank3Q4ACU6 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Shank3Q4ACU6 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Shank3Q4ACU6 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Shank3Q4ACU6 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Shank3Q4ACU6 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Shank3Q4ACU6 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Shank3Q4ACU6 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Shank3Q4ACU6 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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