Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Zfp791-201ENSMUST00000098550 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Tpd52l2-208ENSMUST00000149163 3603 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm44986-201ENSMUST00000206292 2829 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Hdac4-202ENSMUST00000097644 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Sytl4-201ENSMUST00000033608 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Trav9n-4-201ENSMUST00000103626 595 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm16465-201ENSMUST00000118585 1758 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Supt7l-201ENSMUST00000065388 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc171-201ENSMUST00000053414 4525 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Txk-206ENSMUST00000198464 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Dclre1c-202ENSMUST00000100463 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Ints14-202ENSMUST00000170517 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef9-210ENSMUST00000182001 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Cdkl4-201ENSMUST00000086545 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Phka2-201ENSMUST00000033652 4133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Acly-207ENSMUST00000165111 4162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Lipc-201ENSMUST00000034731 1920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Taf1-202ENSMUST00000118878 7210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 Mamdc4-201ENSMUST00000095117 3990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Muc2-201ENSMUST00000026590 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Immt-201ENSMUST00000064062 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Slc2a9-202ENSMUST00000067872 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 Gm18697-201ENSMUST00000191179 2126 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 Foxp3-204ENSMUST00000115740 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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