Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ctdnep1Q3TP92 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms