Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Hoxd10P28359 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Nkrf-201ENSMUST00000057093 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd10P28359 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.2 ms