Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm42932-201ENSMUST00000197280 744 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Musk-207ENSMUST00000177951 3352 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Musk-204ENSMUST00000098059 3352 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Arhgef9-205ENSMUST00000113883 5399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxd9P28357 Nfat5-214ENSMUST00000169453 13380 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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