Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms