Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Vpreb1P13372 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms