Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm8087-201ENSMUST00000119091 567 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 A630023P12Rik-201ENSMUST00000129007 1221 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Rpl21-ps8-201ENSMUST00000130005 478 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 4930570D08Rik-201ENSMUST00000130431 196 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 AC118222.1-201ENSMUST00000222184 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 AC163038.3-201ENSMUST00000223945 558 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm14267-208ENSMUST00000228324 1189 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm5111-201ENSMUST00000064744 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Olfr1373-201ENSMUST00000078264 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Aoc3-202ENSMUST00000103105 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 1700020I14Rik-202ENSMUST00000153581 8300 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Ppfia2-201ENSMUST00000029404 5429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 BC026762-201ENSMUST00000206555 2503 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Depdc5-201ENSMUST00000049780 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Kng1-203ENSMUST00000089902 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm11238-201ENSMUST00000084479 1323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm26785-201ENSMUST00000181775 2914 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Trpm1-218ENSMUST00000206277 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Prokr2-203ENSMUST00000110157 4005 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Fndc1-202ENSMUST00000097425 5845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Kcna2-202ENSMUST00000196403 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm15990-201ENSMUST00000132223 3321 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Meis1-209ENSMUST00000185131 3346 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Aqp9-203ENSMUST00000113570 1712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Umodl1-201ENSMUST00000066554 5007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Phc3-202ENSMUST00000064718 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 1700028E10Rik-203ENSMUST00000201142 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Aldh1l1-201ENSMUST00000032175 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm8049-201ENSMUST00000214336 1782 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Pde6a-201ENSMUST00000025468 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Ctnna1-201ENSMUST00000042345 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Gm32335-201ENSMUST00000216896 2948 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Ttc39b-203ENSMUST00000102823 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Wdr89-202ENSMUST00000187307 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Dpy19l4-201ENSMUST00000084892 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Cyp2d22-201ENSMUST00000023083 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Olfr1357-201ENSMUST00000095473 1826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxb4P10284 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Cog4-202ENSMUST00000165867 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Slc28a1-201ENSMUST00000026820 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Rsrc1-203ENSMUST00000065074 3224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Stox2-202ENSMUST00000110367 3424 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Arhgdib-203ENSMUST00000111892 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm29038-201ENSMUST00000191543 678 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxb4P10284 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms